Sloane trifft sich mit den führenden Köpfen von Prophet Five. Diese teilen ihm mit, dass sie noch einen Auftrag für ihn haben, bevor er alles bekommt, was für Nadias Heilung notwendig ist. Er soll dafür sorgen, dass Sydney eine Mission ausführt. Sloane zögert zunächst, stimmt jedoch zu als man ihm versichert, dass Sydney dabei nichts zustoßen werde.

Unterdes entführt Anna Espinosa im Auftrag von Prophet Five Will Tippin. Wie von ihnen beabsichtig, macht sich Sydney umgehend auf den Weg um ihn zu befreien. Bei dem Kampf mit Anna werden jedoch per Kamera verschiedene Aufnahmen von ihr gemacht. Wieder daheim wird schnell deutlich, dass dies nur der Auftakt war. Bei Will wird eine Bombe im Kopf gefunden und kurz darauf ruft Anna an, um die Seite 47 des Rambaldi-Manuskripts im Austausch gegen das Gerät zum deaktivieren der Bombe zu fordern. Die Übergabe soll in einem Zug in Portugal stattfinden.

Bei der Übergabe gelingt es Anna, Sydney in einem Abteil einzusperren und einen Sprengler zu aktivieren, der Sydney in einer roten Flüssigkeit duschen läßt, die zu einem Großteil wieder aufgefangen wird. Mit Wills Hilfe gelingt es Sydney zwar zu entkommen und den Zünder an sich zu bringen, doch Prophet Five hat, was sie wollten: mit Hilfe der roten Flüssigkeit haben sie Sydneys DNA erhalten.

Mit Annas Einwilligung wird sie in einen Tank mit eben dieser roten Flüssigkeit gesteckt. Als sie schließlich wieder daraus hervorkommt, steht fest: nach Francie und Jim Lennox wurde nun auch Sydney "kopiert". Ist Anna die Frau in der Prophezeihung?